2004年9月16日，GBA游戲《寶可夢 綠寶石》正式在日本發售。本作為為《寶可夢 紅寶石/藍寶石》的加強版本，封面繪有烈空坐。

游戲在《寶可夢 紅寶石/藍寶石》的基礎上增加了新要素，劇情也有些微修改：熔巖隊與海洋隊為兩個爭斗不休的反派集團，分別喚醒了固拉多與蓋歐卡，蘇醒后的兩只寶可夢開始了猛烈的戰斗，在豐緣地區造成劇烈的天氣異常現象，玩家必須喚醒第三只傳說中的寶可夢──烈空坐來平息固拉多與蓋歐卡的紛爭。

《寶可夢 綠寶石》在日本首周共售出79萬1000份，其中第一天就售出了37萬2000份，并為日本2004年銷售第四高的電子游戲。本作于美國為2005年第二暢銷的游戲。共賣出了632萬份。2011年，有報導稱本作仍于日本持續賣出，在2010年中約賣出了7724份。

截至2005年，本作共于歐洲售出120萬份，并于全球售出約500萬份，使其成為第三暢銷的GBA游戲，僅次于《寶可夢 紅寶石/藍寶石》與《寶可夢 火紅/葉綠》。